要在PHP中实现字符串的上标和下标效果，并直接在命令行或网页中正确显示，你可以分别使用Unicode转义序列或HTML实体来表示上标(UPER)和下标(SUB)字符。对于打印到网页的情况，可以使用HTML的<sup>和<sub>标签。但在命令行输出或非HTML环境中，推荐使用Unicode字符。

下标（SUB）
对于下标，如"Log₂FC"中的2，你可以直接插入Unicode下标字符'₂'（U+2082）：
$log = "Log\u{2082}FC";
echo $log; // 输出: Log₂FC，其中2是下标
上标（SUP）
对于上标，比如"M²"中的²，你可以使用Unicode上标字符'²'（U+00B2）：
$squareMeter = "M\u{00B2}";
echo $squareMeter; // 输出: M²
 
注意事项
在Web页面上直接显示这些字符通常没有问题，大多数现代浏览器都支持Unicode。
如果你需要在命令行界面显示这些字符，请确保你的终端支持并正确配置了Unicode。
对于生成的文档（如PDF或Word），使用支持相应格式的库（如TCPDF、PHPWord或之前提到的PhpSpreadsheet）会更加灵活且能更好地控制格式。